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NEB限制性?xún)惹忻附榻B

 更新時(shí)間:2023-06-13 點(diǎn)擊量:3161

NEB向研究界提供限制性?xún)惹忻赋^(guò)45年, 多年來(lái),NEB不斷努力開(kāi)發(fā)出純度最高、性能無(wú)yu倫bi的酶。

NEB限制性?xún)惹忻阜譃槲宕箢?lèi)別,分別是:高保真限制性?xún)惹忻?、Homing 核酸內切酶、Nicking核酸內切酶、表觀(guān)遺傳學(xué)分析中的限制性?xún)惹忻?、省時(shí)有效的限制性?xún)惹忻浮?/p>

1、高保真限制性?xún)惹忻负?jiǎn)介

高保真限制性?xún)惹忻甘峭ㄟ^(guò)交換功能性氨基酸殘基,然后篩選在廣泛條件下發(fā)揮作用的最佳突變體而設計的。無(wú)論你是將消化物放置5-15分鐘還是過(guò)夜,或者使用不同量的酶,高保真限制性?xún)惹忻?/span>都能確保你所需的性能。

2、Homing 核酸內切酶

Homing 核酸內切酶是雙鏈DNA酶,具有大的不對稱(chēng)識別位點(diǎn)(12-40個(gè)堿基對)和通常嵌入內含子或內含子的編碼序列。內含子是由前體RNA剪接而成,而內含子則由前體蛋白質(zhì)剪接而成。歸位核酸內切酶是使用類(lèi)似于限制性核酸內切酶的慣例命名的,其內含子編碼的核酸內切酶包含前綴“I-",而內含子編碼核酸內切酶則包含前綴“PI-"。

Homing 核酸內切酶識別位點(diǎn)極其罕見(jiàn)。例如,在隨機序列的每7 x 1010個(gè)堿基對中,18個(gè)堿基對的識別序列將僅出現一次。這相當于20個(gè)哺乳動(dòng)物大小的基因組中只有一個(gè)位點(diǎn)。然而,與限制性?xún)惹忻覆煌?,歸巢性?xún)惹忻冈谄渥R別序列內容忍一些序列退化。也就是說(shuō),單堿基的改變并沒(méi)有消除裂解,而是在不同程度上降低了裂解的效率。結果,它們觀(guān)察到的序列特異性通常在10-12個(gè)堿基對的范圍內。

3、Nicking核酸內切酶

Nicking核酸內切酶與限制性核酸內切酶一樣使用簡(jiǎn)單。由于6或7堿基缺口內切酶產(chǎn)生的缺口不會(huì )使DNA片段化,因此通過(guò)將超螺旋質(zhì)粒轉化為開(kāi)環(huán)來(lái)監測它們的活性?;蛘?,可以使用在相反的線(xiàn)束上具有足夠近的缺口位置以形成雙絞線(xiàn)切割的基板。

4、表觀(guān)遺傳學(xué)分析中的限制性?xún)惹忻?/span>

許多限制性?xún)惹忻笇NA甲基化狀態(tài)敏感。當識別位點(diǎn)中的特定堿基被修飾時(shí),裂解可能被阻斷或受損。NEB的科學(xué)家最近鑒定了MspJI(NEB#R0661)限制性?xún)惹忻讣易?,該家族依?lài)于甲基化和羥甲基化才能發(fā)生切割。這些酶切除了約32個(gè)堿基對片段,這些片段包含一個(gè)位于中心的5-mC或5-mC修飾的殘基,可以提取并測序。由于這種表觀(guān)遺傳學(xué)修飾的已知位置,在下游分析之前不需要亞硫酸氫鹽轉化。這些表觀(guān)遺傳學(xué)標記驗證的甲基化依賴(lài)性限制性?xún)惹忻笖U大了繪制表觀(guān)遺傳學(xué)修飾的潛力,并簡(jiǎn)化了DNA甲基化的研究。此外,它們?yōu)楦玫亓私?-羥甲基胞嘧啶在基因組中的作用提供了機會(huì )。

我們現有的幾種限制性?xún)惹忻敢部捎糜谘芯緿NA的表觀(guān)遺傳學(xué)修飾,如識別相同序列但不同甲基化模式的DpnI(NEB#R0176)和DpnII(NEB#R0543)。McrBC也只在一條或兩條鏈上切割甲基化胞嘧啶的DNA。MspI(NEB#R0106)和Hpall(NEB#R0171)識別相同的序列(CCGG),但對不同的甲基化狀態(tài)敏感。Hpall只切割一個(gè)wanquan未修飾的位點(diǎn):胞嘧啶上的任何修飾(5-mC、5-mCo或5-ghmC)都會(huì )阻斷切割。MspI會(huì )識別并切割5-hmC和5-hmC,但不會(huì )識別和切割5-ghmc。這些酶包含在EpiMark®5-mC和5-mC分析試劑盒(NEB#E3317)中。

5、省時(shí)有效的限制性?xún)惹忻?/span>

在NEB,酶的生產(chǎn)與限制性修飾系統的克隆和過(guò)表達的基礎研究有關(guān)。這一重點(diǎn)使我們能夠提供濃度極gao的酶,為您的實(shí)驗設計提供更大的靈活性。

無(wú)論您是快速篩選大量克隆還是設置過(guò)夜消化,您都將受益于我們的高質(zhì)量酶。通常,限制性消化包括將1µl酶與1µg純化DNA在50µl的最終體積中孵育1小時(shí)。然而,為了加快篩選過(guò)程,請選擇一種符合時(shí)間節約標準的NEB酶。在推薦的反應條件下,使用1µl的酶,這些酶將在5-15分鐘內消化1µg的底物DNA,也可以安全地用于過(guò)夜消化。與其他供應商不同,沒(méi)有特殊的配方、濃度變化或需要購買(mǎi)更昂貴的新酶系才能在5-15分鐘內完成消化,也不必擔心孵化時(shí)間過(guò)長(cháng)。

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