如何選擇合適的DNA提取試劑盒？

實(shí)驗室工作中，經(jīng)常會(huì )需要用到純化的DNA，這時(shí)我們通常需要使用一個(gè)商業(yè)的DNA提取試劑盒對目的DNA進(jìn)行分離純化。那么我們該如何選擇合適的DNA提取試劑盒呢？讓我們一起來(lái)看看吧！

一、試劑盒組分

目前大多數DNA提取試劑盒遵循相同的基本步驟: 裂解，柱純化，洗滌雜質(zhì)，柱洗脫。然而，不同的盒子在完成每個(gè)步驟的方式上有很大的不同。

二、使用的樣本類(lèi)型

不同的DNA來(lái)源有不同的試劑盒，從實(shí)驗室培養的細胞，到臨床樣本，土壤樣本，甚至指紋，也有許多專(zhuān)門(mén)用于某些應用的試劑盒。

例如，土壤中的腐殖酸或血液中的血紅蛋白會(huì )污染純化的DNA，從而干擾下游的DNA實(shí)驗（如PCR）。當然，也有一些試劑盒會(huì )在進(jìn)行純化步驟之前專(zhuān)門(mén)去除這些組分。

如果想從PCR或瓊脂糖凝膠中純化DNA，有許多方法可以提高瓊脂糖凝膠純化的回收率。

三、基因組與質(zhì)粒DNA提取

一般來(lái)說(shuō)，質(zhì)粒DNA分離要比基因組DNA分離溫和。這是因為針對質(zhì)粒DNA的裂解步驟需要染色體DNA與細胞蛋白片段保持結合，以防止其污染最終的樣品。

兩種類(lèi)型的DNA回收都有試劑盒，甚至有可以同時(shí)純化基因組DNA和總RNA的試劑盒。

四、細胞系與生物體

在選擇DNA提取試劑盒時(shí)，最重要的變量可能是你所使用的生物體。

1. 細菌：

許多試劑盒都有用于細菌DNA分離的不同成分，這些試劑盒之間的主要區別在于細胞是如何被分解的，因為有些細菌比其他細菌更更有挑戰性。

例如，形成生物膜的細菌可能比傳統的基于去垢劑的方法需要更強的裂解技術(shù)。

2. 動(dòng)物組織：

用于動(dòng)物組織DNA分離的試劑盒通常具有更溫和的裂解技術(shù)，因為大多數動(dòng)物細胞不像細菌細胞那樣有細胞壁。

然而，動(dòng)物組織DNA提取的挑戰往往在于選擇合適的組織勻漿方法。此外，許多動(dòng)物DNA純化試劑盒不使用苯酚/氯仿萃取或乙醇作為沉淀步驟，以減少破壞DNA的風(fēng)險。

3. 植物：

當涉及到植物DNA分離時(shí)，必須考慮到其他一些因素，需要注意污染物的去除。

植物在純化過(guò)程中通常含有未分離的糖，因此，洗滌劑選擇性地與DNA結合并從溶液中析出，通常是先將洗滌劑溶解在高濃度的鹽溶液中，然后提取DNA。

4. 血液：

由于技術(shù)上的許多最新進(jìn)展，血液DNA分離試劑盒中有多種裂解技術(shù)和提取方法可供選擇。從血液中分離出的DNA將在很大程度上決定你使用的裂解和提取的類(lèi)型。

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