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瓊脂糖核酸電泳,選擇紫外還是藍光?

 更新時(shí)間:2023-10-16 點(diǎn)擊量:381

DNA分子是一種自身不會(huì )發(fā)出熒光的大分子,需要相應的核酸分子染料結合到DNA分子的大溝處,通過(guò)激發(fā)光激發(fā)DNA –核酸染料復合物,復合物會(huì )發(fā)出一束強熒光,通過(guò)相應的濾光片過(guò)濾得到單波長(cháng)的發(fā)射光,通過(guò)照相機或者肉眼捕獲就能夠檢測到相應的DNA分子。那么瓊脂糖核酸電泳要選擇紫外還是藍光呢?讓我們一起來(lái)看看吧!

從核酸電泳發(fā)展至今,絕大多數的分子生物學(xué)實(shí)驗室選擇溴化乙錠(EtBr,也簡(jiǎn)稱(chēng)EB)作為核酸分子染料,由于EB的光譜特性,又不得不選擇紫外光作為激發(fā)光。EB分子因其分子量較小,容易透過(guò)細胞膜,因此是一種致癌性ji強的有機小分子。而紫外光(UV)照射也會(huì )誘發(fā)基因突變,不僅會(huì )引發(fā)實(shí)驗樣品的基因突變,也會(huì )對實(shí)驗人員造成一定的傷害。

為了解決EB分子的致癌問(wèn)題,科研工作者通過(guò)有機合成技術(shù)將兩個(gè)EB分子通過(guò)有機分子鏈連在了一起,解決了EB分子因分子量比較小容易通過(guò)細胞膜的問(wèn)題,連在一起的分子被稱(chēng)為GelRed。這雖然解決了染料相對安全的問(wèn)題,可激發(fā)光依然是UV,不能夠從本質(zhì)上解決對實(shí)驗樣品和實(shí)驗操作者自身的安全問(wèn)題。

事實(shí)上,除了EB和GelRed這兩種以UV為激發(fā)光的核酸分子染料,還存在另一類(lèi)核酸分子染料,如:GelGreen、SYBR Green、SYBR Gold、LED Green、SYBR Safe、GoldView等以480nm藍光為激發(fā)光的核酸染料,這類(lèi)染料分子量相對較大,細胞膜通透性較差,因此對實(shí)驗人員帶來(lái)的危害較小,相對EB分子是一種較安全的核酸分子染料。

由于波長(cháng)470nm藍光屬于可見(jiàn)光,不會(huì )對實(shí)驗樣品造成破壞,也不會(huì )對實(shí)驗人員造成危害,因此470nm的藍光搭配安全核酸分子染料能夠zui大程度降低核酸瓊脂糖凝膠電泳帶來(lái)的潛在危險。

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